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GPS 与多组学证据整合

用转录组、蛋白组与通路评分整合靶点优先级

本节你将能

解释 GPS/通路评分如何把多组学信号转为可排序的靶点列表。

直觉模型

多组学整合像投票加权:单个数据集是一票,通路一致性是加权系数。

核心要点

  • 差异表达 + 通路富集 → 候选通路
  • 蛋白互作/磷酸化 → 可干预节点
  • 单细胞数据 → 细胞类型特异性靶点
  • 与 QSAR / 结构信息联用,避免「统计显著但不可药」

案例锚点

IPF 等 heterogeneity 高的疾病,bulk 转录组易掩盖关键细胞群——单细胞 GPS 可提升靶点精度。

互动

列出 2 种多组学结果互相矛盾时的处理策略。

常见误区

只看 p 值最小基因当靶点——需结合可成药性与安全表达谱。

本节小结

整合完成后进入本章关卡:给定疾病选靶策略。