ColabFold 实战流程

本节你将能

描述 ColabFold/AlphaFold 笔记本的输入、输出文件与基本参数。

直觉模型

提交氨基酸序列 → 模型推理 → 得到坐标文件与置信度图。

核心要点

• 输入：蛋白质 FASTA（注意长度与资源）
• 输出：PDB/CIF、JSON 置信度
• 可用 PyMOL/Mol* 可视化

常见误区

超长多聚体一次硬跑导致失败——先拆分/简化。

动手

准备一条短蛋白序列并列出期望输出文件清单。

互动

测验：ColabFold 直接输入通常是。

本节小结

下一节用 Python 解析结构文件要点。