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FASTQ 与质量值

reads、Phred 与质控直觉

本节你将能

读懂 FASTQ 四行结构,并解释 Phred 质量值。

直觉模型

每个碱基都带着「可信度分数」;低质量尾部常被裁掉。

核心要点

  • 四行:ID、序列、+、质量
  • Phred:P_error = 10^(-Q/10)
  • 质控工具:FastQC / fastp(概念)

常见误区

忽略接头序列污染——影响比对率。

动手

手算 Q=30 对应错误率。

互动

测验:FASTQ 相对 FASTA 多了什么。

本节小结

下一节:比对到参考基因组。

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