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序列统计与简单可视化

GC、长度分布与快速作图

本节你将能

批量计算长度/GC,并用 matplotlib 画直方图。

直觉模型

先看分布再建模——异常长度或极端 GC 常是污染或接头。

核心要点

  • GC% = (G+C)/len
  • 滑动窗口 GC 看局部偏倚
  • 作图服务于检查,不是装饰

常见误区

不做质控直接进比对——垃圾进垃圾出。

动手

对多序列 FASTA 输出长度与 GC 表。

互动

完成测验;第三章进入比对算法。

本节小结

会读写与统计后,下一章理解比对的打分与 DP。

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