序列统计与简单可视化
GC、长度分布与快速作图
本节你将能
批量计算长度/GC,并用 matplotlib 画直方图。
直觉模型
先看分布再建模——异常长度或极端 GC 常是污染或接头。
核心要点
- GC% = (G+C)/len
- 滑动窗口 GC 看局部偏倚
- 作图服务于检查,不是装饰
常见误区
不做质控直接进比对——垃圾进垃圾出。
动手
对多序列 FASTA 输出长度与 GC 表。
互动
完成测验;第三章进入比对算法。
本节小结
会读写与统计后,下一章理解比对的打分与 DP。
GC、长度分布与快速作图
批量计算长度/GC,并用 matplotlib 画直方图。
先看分布再建模——异常长度或极端 GC 常是污染或接头。
不做质控直接进比对——垃圾进垃圾出。
对多序列 FASTA 输出长度与 GC 表。
完成测验;第三章进入比对算法。
会读写与统计后,下一章理解比对的打分与 DP。